DSpace
 

Thai Agricultural Research Repository >
Publication >
Journal >
Journal of the Thai Veterinary Medical Association under the Royal Patronage >

Please use this identifier to cite or link to this item: http://anchan.lib.ku.ac.th/agnet/handle/001/2725

ARN: TH201100002654
Authors: Supachai Nitipan
Santi Khunthong
Duangjai Suwanchareon
Siriwan Prapong
ศุภชัย นิติพันธ์
สันติ ขันทอง
ดวงใจ สุวรรณ์เจริญ
ศิริวรรณ พราพงษ์
Authors' affiliation: Kasetsart University, Bangkok (Thailand). Interdisciplinary Graduate Program. Genetic Engineering
Kasetsart University, Bangkok (Thailand). Interdisciplinary Graduate Program. Genetic Engineering
Department of Livestock Development, Bangkok (Thailand). National Institute of Animal Health
Kasetsart University, Bangkok (Thailand). Faculty Veterinary Medicine. Department of Physiology
Authors' affiliation (Thai): มหาวิทยาลัยเกษตรศาสตร์ โครงการสหวิทยาการระดับบัณฑิตศึกษา สาขาพันธุวิศวกรรม
มหาวิทยาลัยเกษตรศาสตร์ โครงการสหวิทยาการระดับบัณฑิตศึกษา สาขาพันธุวิศวกรรม
กรมปศุสัตว์ สถาบันสุขภาพสัตว์แห่งชาติ
มหาวิทยาลัยเกษตรศาสตร์ คณะสัตวแพทยศาสตร์ ภาควิชาสรีรวิทยา
Title: Molecular markers from LipL36 gene and IS 1533 for identifying Leptospires by technique Polymerase Chain Reaction
เครื่องหมายโมเลกุลจากยีน LipL36 และ IS 1533 สำหรับใช้จำแนกเชื้อเลปโตสไปร์ด้วยปฏิกิริยาลูกโซ่โพลิเมอเรส
Issue Date: 2005
Language: tha
Keywords: โรคเลปโตสไปโรซีส
เลปโตสไปร์
เครื่องหมายโมเลกุล
ปฏิกิริยาลูกโซ่โพลิเมอเรส
ยีน LipL36
ยีน IS1533
การจำแนกเชื้อ
Subject Classification(ASC): L73
AGROVOC: Leptospirosis
Bacteria
Genetic markers
PCR
Genes
Identification
โรคฉี่หนู
แบคทีเรีย
เครื่องหมายทางพันธุกรรม
พีซีอาร์
ยีน
การจัดจำแนก
Abstract: Leptospire sp. is a spirocheate bacterias that causes leptospirosis in animals and human. The results from PCR identification method by two sets of primer (G1, G2, B64I and B64II) with Thailand pathogenic leptospires shown different results from the earlier reports and they can not be used as molecular markers for serovars identification Leptospires cultured from local strain pathogen. In this experiment, we constructed molecular markers by sets of primer from different genes, genes encoding outer membrane protein, LipL36 and OmpL1, and gene IS1533. Size and amount of PCR products were used as markers. They were generated by low stringency condition (LS-PCR) for LipL36 primer set, and by amplifying DNA fragments adjacent IS1533. The results from 24 reference Leptospire sp. serovars has shown that molecular markers from LipL36 primers has more polymorphic and strong PCR products than IS-1 primer. PCR products from both primer sets can be used as molecular markers for serovars identification. Although, the data from IS-1 primer can not solely differentiate each serovars. Therefore, we suggest to use these markers from both primer sets together for leptospire sp. identification.
เชื้อเลปโตสไปร์เป็นเชื้อแบคทีเรียชนิดสไปโรขีดที่เป็นสาเหตุของโรคเลปโตสไปโรซีส ซึ่งการตรวจวินิจฉัยด้วยปฏิกิริยาลูกโซ่โพลิเมอเรสด้วยไพรเมอร์ G1/G2 และ B64I/B64II กับเชื้อเลปโตสไปร์ที่ก่อโรคในประเทศไทย ให้ผลที่แตกต่างจากการรายงานมาก่อนหน้านี้ อีกทั้งยังไม่สามารถจำแนกในระดับซีโรวาร์ได้ ดังนั้นในการทดลองนี้จึงได้ทำการสร้างเครื่องหมายโมเลกุลโดยใช้ไพรเมอร์ 2 ชุดซึ่งมีการออกแบบจากส่วนของสารพันธุกรรมที่ทำหน้าที่ต่างกัน คือไพรเมอร์ที่ออกแบบจากข้อมูลของยีน LipL36 และ OmpL1 ซึ่งเป็นยีนที่เกี่ยวข้องกับการสร้างแอนติเจนบนผิวเซลล์ของเชื้อเลปโตสไปร์แล้วนำมาเพิ่มปริมาณดีเอ็นเอด้วยปฏิกิริยาลูกโซ่โพลิเมอเรสแบบ low-striengency PCR (LS-PCR) และใช้ไพรเมอร์ IS-1 ซึ่งออกแบบมาจากข้อมูลของ IS1533 ซึ่งเป็นส่วนของ insertion sequence โดยจะเพิ่มปริมาณดีเอ็นเอที่อยู่ระหว่าง IS1533 ที่อยู่ติดกัน จากผลการทดลองพบว่าเครื่องหมายโมเลกุลที่ได้จากการใช้ไพรเมอร์ LipL36 ด้วยวิธี LS-PCR กับเชื้อเลปโตสไปร์อ้างอิง 24 ซีโรวาร์ มีปริมาณและขนาดที่หลากหลายมากกว่าเมื่อนำมาเปรียบเทียบกับเครื่องหมายโมเลกุลที่ได้จากไพรเมอร์ IS-1 และข้อมูลเครื่องหมายโมเลกุลที่ได้จากไพรเมอร์ทั้งสอง สามารถนำมาใช้ในการจำแนกเชื้อเลปโตสไปร์แต่ละซีโรวาร์ได้ อย่างไรก็ตามข้อมูลที่ได้จากการใช้ไพรเมอร์ IS-1 เพียงชุดเดียวยังไม่สามารถใช้ในการจำแนกเชื้อในบางซีโรวาร์ได้ ดังนั้นในการนำเครื่องหมายโมเลกุลที่ได้ไปใช้ในการจำแนกเชื้อแต่ละซีโรวาร์ทางห้องปฏิบัติการจึงต้องมีการใช้เครื่องหมายโมเลกุลที่ได้จากไพรเมอร์ทั้งสองมาประกอบร่วมกัน
ISSN: ISSN 0125-0620
Availability : Thai National AGRIS Centre, Office of The University Library Kasetsart University, P.O. BOX 1084 Kasetsart Chatuchak, Bangkok 10903, Thailand
Availability: สำนักหอสมุด ม.เกษตรศาสตร์
Appears in Collections:Journal of the Thai Veterinary Medical Association under the Royal Patronage

Files in This Item:

File Description SizeFormat
TAB000125490234c.pdf6.58 MBAdobe PDFView/Open
TAB000125490234b.pdf112.72 kBAdobe PDFView/Open
TAB000125490234a.pdf2.17 MBAdobe PDFView/Open

Items in DSpace are protected by copyright, with all rights reserved, unless otherwise indicated.

 

Valid XHTML 1.0! DSpace Software Copyright © 2002-2009  The DSpace Foundation - Feedback