DSpace
 

Thai Agricultural Research Repository >
Publication >
Journal >
Journal of the Thai Veterinary Medical Association under the Royal Patronage >

Please use this identifier to cite or link to this item: http://anchan.lib.ku.ac.th/agnet/handle/001/2739

ARN: TH201100002668
Authors: Lerdchai Chintapitaksakul
Rapiphan Uavechanichkul
Kalaya Kengvikkum
เลิศชัย จินตพิทักษ์สกุล
รพีพรรณ เอื้อเวชนิชกุล
กัลยา เก่งวิกย์กรรม
Authors' affiliation: Department of Livestock Development, Pathum Thani (Thailand). Bureau of Biotechnology for Animal Production
Department of Livestock Development, Pathum Thani (Thailand). Bureau of Biotechnology for Animal Production
Department of Livestock Development, Pathum Thani (Thailand). Bureau of Biotechnology for Animal Production
Authors' affiliation (Thai): กรมปศุสัตว์ สำนักเทคโนโลยีชีวภาพการผลิตปศุสัตว์
กรมปศุสัตว์ สำนักเทคโนโลยีชีวภาพการผลิตปศุสัตว์
กรมปศุสัตว์ สำนักเทคโนโลยีชีวภาพการผลิตปศุสัตว์
Title: Evaluation of an alternative method, without phenol-chloroform extraction, used for bull genomic DNA preparations derived from blood, semen and hair bulbs
การประเมินวิธีการสกัดแยกดีเอ็นเอจากเลือด น้ำเชื้อและเซลล์รากขนของพ่อพันธุ์โค
Issue Date: 2005
Language: eng
Keywords: โค
พ่อพันธุ์
เลือด
เซลล์รากขน
น้ำเชื้อ
จีโนมิคดีเอ็นเอ
การสกัดแยก
Subject Classification(ASC): L10
AGROVOC: Cattle
Bulls
Breeding stock
Blood
Hair
Semen
Genomes
DNA
Extraction
โค
โคตัวผู้
พ่อแม่พันธุ์สัตว์
เลือด
ขนสัตว์
น้ำอสุจิ
จีโนม
ดีเอ็นเอ
การสกัด
Abstract: There are several protocols for isolation of genomic DNA. A standard method using phenolchloroform mixture in extraction step is widely used. This study was performed to evaluate two different methods, for preparation of genomic DNA used for genotyping with and without phenol-chloroform extraction. Samples are blood, semen and hair bulbs from three bulls. Method A, without phenol-chloroform in the extraction procedure, genomic DNA was preceded directly to the PCR reaction of six microsatellite markers. Method B, with phenol-chloroform extraction, is a standard method in this study performed as method A followed by phenol-chloroform treatment. The PCR products were not observed by method A in amplified reaction using DNA templates extracted from blood and semen, whereas DNA template derived from hair bulbs using method A could be observed in agarose gel after electrophoresis. The fragment size of four out of six microsatellite markers from the reactions of three bulls using hair bulbs with method A gave the identical to the DNA prepared by method B. The result suggested that the one-step method (method A) for preparation of genomic DNA from hair bulbs is proven useful, practical and it can be an alternative method to obtain DNA in the process of genotyping.
การศึกษาครั้งนี้เป็นการประเมินวิธีการสกัดจีโนมิคดีเอ็นเอด้วยวิธีที่แตกต่างกัน 2 วิธี เรียกว่าวิธีเอและวิธีบี ซึ่งวิธีเอเป็นการสกัดแยกจีโนมิคดีเอ็นเอที่ผ่านการย่อยสลายเซลล์ด้วยสารละลายที่ประกอบด้วยโปรตีนเนสเค ส่วนวิธีบีมีขั้นตอนเหมือนวิธีเอแต่เพิ่มขั้นตอนการแยกสกัดด้วยสารผสมฟีนอล-คลอโรฟอร์ม ซึ่งวิธีบีเป็นวิธีมาตรฐานที่ใช้กันอย่างแพร่หลาย จากการนำตัวอย่างเลือด น้ำเชื้อ และเซลล์รากขนของพ่อพันธุ์โค 3 ตัว มาสกัดแยกจีโนมิคดีเอ็นเอด้วยสองวิธีแล้วทดสอบ ผลการสกัดแยกด้วยปฏิกริยาลูกโซ่ (พี ซี อาร์ ) ด้วยเครื่องหมายพันธุกรรมไมโครแซทเทิลไลต์ พบว่าจีโนมิคดีเอ็นเอที่ได้จากเซลล์รากขนที่สกัดด้วยวิธี เอ, และจากเลือด น้ำเชื้อ และเซลล์รากขนที่สกัดด้วยวิธีบีสามารถนำไปผ่านปฏิกริยาลูกโซ่ได้อย่างดีและได้ผลิตภัณฑ์ของปฏิกริยาลูกโซ่ตามที่ต้องการ ส่วนจีโนไทปิงของเซลล์รากขนที่ได้จากเครื่องหมายพันธุกรรมไมโครแซทเทิลไลต์ 4 ใน 6 ตัว ให้ผลตรงกัน ผลการศึกษานี้ สรุปได้ว่าวิธีเอและบีสามารถนำมาใช้สกัดแยกจีโนมิคดีเอ็นเอจากเซลล์รากขนได้
ISSN: ISSN 0125-0620
Availability : Thai National AGRIS Centre, Office of The University Library Kasetsart University, P.O. BOX 1084 Kasetsart Chatuchak, Bangkok 10903, Thailand
Availability: สำนักหอสมุด ม.เกษตรศาสตร์
Appears in Collections:Journal of the Thai Veterinary Medical Association under the Royal Patronage

Files in This Item:

File Description SizeFormat
TAB000125491550c.pdf9.05 MBAdobe PDFView/Open
TAB000125491550b.pdf106.24 kBAdobe PDFView/Open
TAB000125491550a.pdf2.66 MBAdobe PDFView/Open

Items in DSpace are protected by copyright, with all rights reserved, unless otherwise indicated.

 

Valid XHTML 1.0! DSpace Software Copyright © 2002-2009  The DSpace Foundation - Feedback